Gobierno

La UCSE tiene posee cuatro sedes académicas en las ciudades de Santiago, Jujuy, Rafaela y Buenos Aires.

En la Sede de Santiago funciona el Rectorado y cuatro Facultades, en cada una de las restantes sedes funcionan sendos Departamentos Académicos.

El artículo Nº 11 del Estatuto Académico, indica que para su dirección y administración académica los órganos de gobierno son:

• El Consejo Superior. 
• El Rectorado (Rector y Vicerrectores) 
• Los Consejos de Facultad. 
• Los Decanatos (Decano y Vicedecano) 
• Los Consejos de Departamento Académico 
• Las Direcciones de Departamento Académico (Director y Vicedirector) 

Gestión

En la Sede Santiago funcionan las Facultades de Ciencias Económicas; Ciencias Políticas, Sociales y Jurídicas; Ciencias de la Salud y Ciencias para la Innovación y el Desarrollo. Cada una de ellas cuenta con Consejo de Facultad, Decano, Secretaría de Facultad y Coordinadores de carrera y área.

Los Departamentos Académicos reproducen a su interior una estructura organizacional similar. Hay un Consejo de Departamento, Director, Subdirector y tres Secretarías: Académica, Administrativa y de Extensión.